自新冠肺炎疫情爆发以来，关于“病毒从何而来”的追问和争论，从未停息。4月8日，剑桥大学研究人员发表在《美国科学院院刊》的一篇针对新冠病毒溯源的研究显示，美国2/3的患者感染的是始祖病毒，中国感染最多的则是子代病毒。

新冠病毒目前已是“三世同堂”

研究人员在对160例新冠样本进行全基因组分析后，绘制出了新冠病毒的进化图谱。

根据氨基酸变化，研究者发现，截至3月4日，新冠病毒已是“三世同堂”，祖先为A（T29095C），子代为B（T8782C/C28144T），孙子辈为C（G26144T）。

A类冠状病毒起源于蝙蝠，B是A的后代，C是B的后代。这三类变异体在全球范围的分布情况，差异极大。

美国2/3的患者感染的是始祖病毒 中国感染最多的是子代病毒

研究者指出，A型新冠病毒最早在中国武汉现身，但却在美国和澳大利亚“开枝散叶”，近一半（15/33）分布在这两个国家。此外，美国患者的样本，三分之二感染的是A型病毒。在东亚以外的地区，即欧洲和美国，A型和C型占比很大。

B型集中分布在中国及东亚地区（B型共有93个亚型：中国53个，东亚各国21个，欧美等其他地区19个）。东亚地区的B型毒株突变缓慢，且在突变之前始终未能传播到东亚以外的地区。东亚地区以外的19个B型毒株都发生了突变。研究人员推测，这可能是“始祖效应”，即东亚以外的环境及宿主免疫因素，不适宜B病毒传播，因此发生了突变。

需要提醒的是，在2月底的一次记者会上，钟南山院士曾提醒大家，“首先发现”和“发源”不能直接划上等号。只有对新冠病毒进行溯源，有了结果，才可能回答病毒源自哪里这一问题。

中国大陆不存在孙子辈病毒——C型毒株

欧洲地区样本的病毒株主要类型是C型，包括法国、意大利、瑞典和英国，以及美国加利福尼亚州和巴西。在新加坡、香港、台湾和韩国的样本中，也有C型存在。一个有意思的发现是，中国没有发现C型。

病毒溯源 有助于防止新冠在全球范围内反复传播

追溯新冠病毒的源头，然后对其隔离，有助于防止疾病在全球范围内反复传播。

该研究已进行同行评议，但由于样本量较小，尚不能确定是否具有普遍意义。

为弥补上述局限性，目前该研究团队已经更新了他们的数据，纳入了截至3月底的1000多例新冠病例。

论文的第一作者Peter Forster说：“我们所详细探究的病毒网络，是在COVID-19的进化路径被大量突变所掩盖之前，留下流行病早期阶段的快照，这就好像是在捕捉一颗正在形成的超级新星，记录下它的发展轨迹。”他接受媒体采访时还介绍，最新研究表明，COVID-19病毒第一次感染人类并在人类中传播，发生在2019年9月13日到12月7日之间。

此前曾有媒体报道，意大利米兰大学的医学统计学教授德卡利调查发现，去年10月至12月，米兰和洛迪两地因肺炎和流感住院的病人人数“显著增加”，其中一些人已经死亡。此外，米兰和洛迪在此次新冠肺炎疫情最严重城市的名单之列。

因此，新冠疫情最早发生在哪个国家，仍无定论，需要更多更可靠的研究，来停止纷争。

PNAS first published April 8, 2020
Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes
https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117

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