基因学变量模型预测尿路上皮癌患者化疗反应可能优于临床因子模型
尿路上皮癌对含铂方案的治疗应答个体差异大,既往研究多关注体细胞DNA,那么生殖系细胞DNA多态性是否会影响尿路上皮癌的化疗敏感性?9月发表于《Ann Oncol》的一项研究证明,基因学变量的模型对于预测化疗反应性可能优于仅使用临床因子的模型。
背景:尿路上皮癌(UC)对含铂化疗方案应答的多态性很常见,且常被归因于体细胞DNA的基因和表观遗传的多样性。我们假设生殖细胞DNA的多态性会影响UC的化疗敏感性。
患者和方法:对210例接受过含铂方案化疗的患者的DNA进行基因型分析,得到80个单核苷酸多态性(SNPs)。使用Logistic回归,分析SNPs与治疗应答之间的相关性,并创建多变量预测模型。将重要SNPs位点相结合进行分析,形成SNP得分预测化疗应答性。对11个UC细胞系进行基因型分析作为验证,。
结果:6个SNPs与101个完全应答或部分应答显著相关(48%)。4个SNPs保持独立相关,并被纳入应答预测模型。每个额外的风险等位基因与应答优势比降低近50%相关(优势比(OR)= 0.51,95%置信区间,0.39~0.65,P = 1.05 × 10−7)。该模型的曲线下引导调整区域比仅使用临床预后因子模型的区域大(0.78 vs 0.6)。结果显示,SNP得分与细胞系中的化疗药物敏感性呈正相关(P = 0.115)。
结论:本研究对生殖系细胞DNA中,影响UC对含铂化疗应答性相关的基因学变量进行了研究。使用这些基因学变量建立的模型对于预测化疗反应性可能优于仅使用临床因子的模型。
(选题审校:张萌萌 编辑:吴星)
(本文由北京大学第三医院药剂科翟所迪教授及其团队选题并审校,环球医学资讯编辑完成。)
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