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厉害!分析基因表达生物标志物即可知甲氨蝶呤无反应的RA患者

来源:环球医学编写    时间:2019年05月16日    点击数:    5星

2019年5月,英国和美国学者发表在《Arthritis Rheumatol》的一项研究,调查了基因表达生物标志物的分析能否为类风湿关节炎(RA)患者甲氨蝶呤(MTX)是否反应提供早期分类。

目的:约30%~40%初始低剂量MTX的RA患者不能从治疗中获益。至今,还没有鉴别出RA患者MTX无效的可靠标志物。本研究旨在分析RA患者2个时间点(治疗前和初始MTX后4周)的全血样本,从而鉴别出MTX应答的基因表达生物标志物。

方法:从Rheumatoid Arthritis Medication Study中选择即将开始MTX治疗的RA患者。使用欧洲风湿病联盟(EULAR)应答标准,将初始MTX治疗后6个月时的42名患者分为良好应答者,43人分为非应答者。生成了全血转录表达数据,监督机器学习方法用于预测EULAR非应答。纳入转录水平的模型与仅纳入临床协变量(如基线疾病活跃度、性别)的模型进行了比较。也进行了基因网络和本体分析。

结果:基于转录值的比值(即,治疗4周和治疗前之间log2转化表达值的差异),使用L2-正规化逻辑回归(平均±SEM接受者操作特征(ROC)曲线下面积(AUC),0.78±0.11)开发了MTX非应答的高度预测分类法。该分类法优于纳入了临床协变量的模型(ROC AUC0.63±0.06)。基因网络的通路分析提示,治疗前(P=2.8×10−25)和初始治疗后4周时(P=4.9×10−28),非应答者I型干扰素信号通路基因显著过度表达。

结论:治疗前和治疗后4周之间基因表达改变的检测,可为不可能从6个月的MTX治疗中获益的RA患者的提供早期的MTX治疗应答的分类。因此,此类患者的治疗应更迅速地升级,否则可能潜在影响治疗途径。这些结果强调了早期治疗生物标志物监测在开始MTX治疗的RA患者中的重要作用。

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30615300

(选题审校:苏珊 编辑:王淳)

(本文由北京大学第三医院药剂科翟所迪教授及其团队选题并审校,环球医学资讯编辑完成。)

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