生物标记物对吉西他滨反应差异有影响
对肿瘤药物吉西他滨反应可能存在很大的差异,部分归因于负责其代谢和处置的酶和转运蛋白的遗传学差异。2014年2月发表在《Pharmacogenet Genomics》上的一项研究旨在识别吉西他滨反应显著相关的基因变异,综合的分析中识别出的生物标记物对吉西他滨反应差异有影响。
目的:对肿瘤药物吉西他滨反应可能存在很大的差异,部分归因于负责其代谢和处置的酶和转运蛋白的遗传学差异。本生物信息学研究旨在识别与吉西他滨反应显著相关的基因变异,这可能有助于临床的个体化治疗。
方法:我们对两个单独的数据集进行分析:(a)使用Affymetrix DMET 1.0平台的NCI-60细胞系的基因型数据并联合这些细胞系中吉西他滨细胞毒数据,(b)NCI赞助的III期临床试验中351名胰腺癌患者治疗的全基因组关联研究(GWAS)数据。我们还对135名给予吉西他滨+安慰剂患者的GWAS数据集开展了一项子集分析。对每个个体数据进行统计学和系统生物学分析,以识别出与吉西他滨反应显著相关的生物标记物。
结果:ABC转运蛋白(ABCC1、ABCC4)和CYP4家庭成员CYP4F8和CYP4F12、CHST3和PPARD的基因变异在NCI-60和GWAS数据中均显著。我们报道了药物反应和软骨素磺基转移酶(CHST)家庭成员内变异显著相关,软骨素磺基转移酶在吉西他滨反应中的作用尚未确定。
结论:综合的分析中识别出的生物标记物对吉西他滨反应差异有影响。由于基因型数据更易获得,开展相似的研究来了解药物反应的机制,从而利于临床试验设计和标准评价。
(选题审校:唐惠林 编辑:王淳)
(本文由北京大学第三医院药剂科翟所迪教授及其团队选题并审校,环球医学资讯编辑完成。)
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