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感染

不速之客新冠病毒 竟与SARS使用同一把钥匙进入人体

来源:    时间:2020年04月14日    点击数:    5星

2019年年底,不速之客新型冠状病毒突然造访,我们对其一无所知。2020年2月,中国和澳大利亚学者在《Lancet》发表的一项研究,考察了2019新型冠状病毒的基因组特征和流行病学,初步揭示了病毒的起源和通过何种途径进入人体。

不速之客新冠病毒 有何来头?

2019年12月末,中国武汉报告了因不明原因微生物导致的病毒性肺炎患者。随后,识别出新型冠状病毒乃致病微生物,暂命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。截止到2020年1月26日,已经确诊超过2000例2019-nCoV感染患者,多数居住在武汉或到过武汉,并证实有人传人。

然而,新冠病毒从何而来,又是如何进入人体,我们需要考究清楚,才能更好应对和避免未来重蹈覆辙。

新冠病毒可能来源于蝙蝠 通过血管紧张素转换酶2(ACE2)受体进入人体

发表在《Lancet》的该研究,对9名住院患者的支气管肺泡灌洗液进行了新一代测序检测,并对分离株进行培养,其中8人曾到过武汉华南海鲜市场。剩下的1名患者从未去过华南海鲜市场,但在发病之前曾住在这家市场附近的一家旅馆里。

从这些患者中获取了完整和部分2019-nCoV基因组序列。使用桑格测序对病毒重叠群进行连接,从而获得全长基因组,通过cDNA末端的快速扩增确定其末端区域。

对这些2019-nCoV基因组与其他冠状病毒基因组进行亲缘性分析,以确定病毒的进化史,并推断其可能的起源。同源建模用于探讨病毒可能的受体结合特性。

从9名患者中获得的10个2019-nCoV基因组序列(8个完整的基因组和2个部分基因组)极其相似,序列一致性超过99.98%,表明这种病毒是最近才出现在人体内。

值得注意的是,2019-nCoV与从华东舟山2018年收集的两种蝙蝠源性严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒密切相关(88%同源性),即bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21,然而与SARS-CoV(约79%)和MERS-CoV(约50%)相差较远。

亲缘性分析表明,2019-nCoV属于桦木冠状病毒属的沙贝病毒亚属,分枝长度相对长于其近亲bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21,基因上不同于SARS-CoV。

另外,同源建模提示,尽管一些关键残基上的氨基酸有差异,但2019-nCoV与SARS-CoV的受体结合结构域相似。

因此,2019-nCoV显著不同于SARS-CoV,是一类新的可感染人类的β-冠状病毒。虽然亲缘性分析提示,蝙蝠可能为该病毒的原始宿主,但是武汉海鲜市场售卖的一种目前未知的野生动物可能是促进病毒在人体内出现的中间宿主。

重要的是,结构性分析表明,2019-nCoV可与人体中的ACE2受体结合。该病毒未来如何演化、适应和传播,急需展开调查。

野生动物体内隐藏着病毒库 随时可能威胁人类

本文的通讯作者表示:“令人吃惊的是,文中描述的来自不同患者的2019-nCoV序列几乎相同。这一发现表明,2019-nCoV在很短的时间内起源于一个来源,并且被相对快速地检测到。但是,随着这种病毒传播给更多人,不断监测突变的出现很有必要。”

此前的研究发现了不同冠状病毒可能的结合受体,如SARS-CoV与ACE2结合,MERS-CoV与CD26。通过研究病毒的刺突蛋白,研究人员发现2019-nCoV与人SARS-CoV结构相似,不过也存在一些细微差异。因此,他们提出2019-nCoV进入人体细胞,可能使用了与SARS相同的分子入口——人细胞表面上的ACE2受体。但请注意,这仍需要进一步确认。

此外,蝙蝠冠状病毒发生重组的可能性要高于2019-nCoV,且更复杂,这意味着2019-nCoV不太可能是由于病毒重组而出现。但是,还需要更多的信息来确认这一点,而且如果发现了亲缘关系更为密切的动物病毒,那么这一建议则可能是错误的。

总之,此次疫情爆发再次凸显了野生动物体内隐藏着病毒库,对人类构成了潜在威胁。

 

(选题审校:何娜 编辑:丁好奇)
(本文由北京大学第三医院药剂科翟所迪教授及其团队选题并审校,环球医学资讯编辑完成。)

 

参考资料:
Lancet, 395 (10224), 565-574 2020 Feb 22 
Genomic Characterisation and Epidemiology of 2019 Novel Coronavirus: Implications for Virus Origins and Receptor Binding 
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32007145

 

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