肺炎克雷伯氏菌对第三代头孢菌素和碳青霉烯类抗生素耐药屡见报道。2015年1月，发表在《Antimicrob Agents Chemother》上的一项研究对肺炎克雷伯氏菌菌株的基因组进行序列测定。

肺炎克雷伯氏菌处于对革兰氏阴性致病菌抗菌药物耐药的最前列，其菌株对第三代头孢菌素和碳青霉烯类抗生素耐药屡见报道。由于高致病率和高死亡率经常与医院环境下肺炎克雷伯氏菌感染相关，所以这些菌株在世界范围内的扩散引起了我们极大的关注。我们对从6家意大利医院中分离出来的89个肺炎克雷伯氏菌菌株的基因组进行序列测定。我们是基于抗生素类型而非多位点序列分型选取菌株，以获取意大利肺炎克雷伯氏菌的流行病学特征。31个菌株是碳青霉烯类耐药的肺炎克雷伯菌的碳青霉烯酶生产者，29个对第三代头孢菌素耐药，29个易受上述抗生素影响。基因组与数据库中所有的现有序列进行了比较，获得了319个基因组的数据集，这些数据涵盖了世界范围内已知的肺炎克雷伯氏菌的多样性。该全球数据集的生物信息学分析允许我们构建一个完整的物种的亲缘关系，以检测抗生素耐药性的分布模式，并找出感兴趣的具体分支间区别。最后，我们检测到一个约1.3Mb的重组，该重组描述了所有克隆复合体258分离株（肺炎克雷伯氏菌最普遍的碳青霉烯类抗生素耐药组）的特征。我们对该复合体的进化进行了建模，融入了新检测的和之前报道的重组事件。本研究对理解肺炎克雷伯氏菌的进化做出了贡献，为其全球基因组的特征提供了新的观点，并指出了该病原体在意大利的流行病学情况。

（选题审校：周俊文 编辑：贾朝娟）

（本文由北京大学第三医院药剂科翟所迪教授及其团队选题并审校，环球医学资讯编辑完成。）

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