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北京市2022年SARS-CoV-2变异株的特征分析 有无新的变异株?

来源:环球医学编写    时间:2023年07月10日    点击数:    5星

2022年11月14日前后,北京新冠疫情暴发,此期间有无新变种出现呢?2023年2月,发表在《Lancet》的一项研究,收集了2022年1月~12月北京输入病例和本地病例的呼吸道样本,分析发现BF.7和BA.5.2的共同流行一直存在,没有证据表明出现了新变种。

背景:因我国新冠动态清零策略,2022年前,新冠病毒未在北京市本地传播。然而,在过去3年中,经常发现输入性病例。随着最近中国新冠病例数量的激增,人们担心可能会出现新型变异株。在过去的3年里,北京对病毒基因组进行了常规监测。将近期病毒基因组序列与全球汇总和本地数据进行时空分析,对全球应对新冠疫情至关重要。

方法:在过去3年中定期收集了北京输入病例和本地病例的呼吸道样本(本研究的样本收集自2022年1月~12月),然后随机选择样本进行分析。新一代测序用于生成新冠病毒基因组。本研究使用高质量的完整序列进行了系统进化和种群动态分析。

结果:在这项研究中,总共获得了2994个完整的新冠病毒基因组序列,其中的2881个是高质量的,用于进一步分析。11月14日~12月20日,对413个新样本进行了测序,其中包括350个本地病例和63个输入病例。所有这些基因组都属于现有的123Pango谱系,表明没有持续的优势变体或新谱系。然而,目前在北京以BA.5.2和BF.7为主,占到11月14日以来本地病例的90%(本研究测序的315/350例本地病例)。2022年11月14日后,北京BA.5.2和BF.7的有效人口规模均有所增加。

结论:自2022年11月14日在北京暴发以来,BF.7和BA.5.2的共同流行一直存在,没有证据表明出现了新变种。虽然该数据来自于北京,但由于人口频繁流动和高传播性循环毒株的存在,这一结果可以被视为中国的一个缩影。


(选题审校:何娜 编辑:贾朝娟)
(本文由北京大学第三医院药剂科翟所迪教授及其团队选题并审校,环球医学资讯编辑完成。)


参考资料:
Lancet. 2023 Feb 25;401(10377):664-672
Characterisation of SARS-CoV-2 variants in Beijing during 2022: an epidemiological and phylogenetic analysis
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36773619/
 

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